เมื่อวันที่ 11 ก.ย. 67 ที่กองบัญชาการกองทัพน้อยที่ 3 ค่ายสมเด็จพระเอกาทสรถ อ.เมือง จ.พิษณุโลก ได้มีพิธีจัดงานวันสถาปนากองทัพน้อยที่ 3 ครบรอบปีที่ 35 เพื่ออุทิศส่วนกุศลให้กับอดีตข้าราชการของหน่วยงานที่ล่วงลับไปแล้ว มีพล.อ.ถนอม วัชรพุทธ อดีตแม่ทัพภาคที่ 3 เป็นประธาน ประกอบพิธีบำเพ็ญกุศล ซึ่งมีอดีตนายทหารชั้นผู้ใหญ่มาร่วมงานกันเป็นจำนวนมาก อาทิ พล.อ.ศิริ ทิวะพันธุ์ อดีตแม่ทัพภาคที่ 3 พล.อ.จิรเดช คชรัตน์ อดีตแม่ทัพภาคที่ 3 พล.อ.สาธิต พิธรัตน์ อดีตแม่ทัพภาคที่ 3 พล.อ.อภิเชษฐ์ ซื่อสัตย์ อดีตแม่ทัพภาคที่ 3 พล.อ.นฤทธิ์ ถาวรวงษ์ ผู้ทรงคุณวุฒิพิเศษกองทัพบก อดีตแม่ทัพน้อยที่ 3
พล.ท.กิตติพงษ์ แจ่มสุวรรณ แม่ทัพน้อยที่ 3 พร้อมคณะให้การต้อนรับ อดีตผู้บังคับบัญชาระดับสูง หัวหน้าส่วนราชการ ทหาร ตำรวจ ข้าราชการพลเรือน รัฐวิสาหกิจ ร่วมพิธีบำเพ็ญกุศล เพื่อความสิริมงคลแก่ข้าราชการและครอบครัว พร้อมทั้งอุทิศให้กับข้าราชการของหน่วยที่ล่วงลับไปแล้ว ในการปฏิบัติหน้าที่ปกป้องอธิปไตยของชาติ และพัฒนาดูแลประเทศชาติและประชาชนมาอย่างต่อเนื่อง
โดยกองทัพน้อยที่ 3 จัดตั้งขึ้นตามคำสั่งกองทัพบก(เฉพาะ)ลับ ที่ 156/32 มีการจัดตั้งกองบัญชาการ กองทัพน้อยที่ 3 ชั่วคราว ค่ายสมเด็จพระเอกาทศรถ ตั้งแต่วันที่ 1 พฤศจิกายน 2532 ถึง24 มกราคม 2533 และได้เคลื่อนย้ายเข้าที่ตั้งชั่วคราว บริเวณอาคารของหน่วยกองร้อยลาดตระเวนระยะไกลที่ 4 (เดิม) ค่ายสมเด็จพระเอากาทศรถ พ.ศ.2534 กองทัพบกปรับหน่วยจากเดิมเป็นการจัดหน่วยตามอัตราการจัดและยุทโธปกรณ์ หมายเลข 52-2 โดยบรรจุอัตรากำลังพลในอัตราลดระดับ 2 พ.ศ.2536 ได้รับงบประมาณจากกองทัพบกมาดำเนินการก่อสร้างอ่าคารกองบัญชาการกองทัพน้อยที่ 3 พ.ศ. 2537 ได้ย้ายจากที่ตั้งชั่วคราวมาเข้าสู่ที่ตั้งปกติถาวร เป็นอาคารกองบัญชาการกองทัพน้อยที่ 3 ตั้งแต่วันที่ 11 กันยายน 2537 จนถึงปัจจุบัน
พ.ศ.2537 มีที่ตั้งชั่วคราวอยู่ ณ กองพันพัฒนาที่ 3 อำเภอแม่ริม จังหวัดเชียงใหม่ รับผิดชอบพื้นที่ชายแดนไทย-เมียนมา ตั้งแต่จังหวัดตาก จนถึงจังหวัดเชียงราย พ.ศ.2539-2550 กองทัพภาคที่ 3 มอบให้กองทัพน้อยที่ 3 วางแผนและดำเนินการเกี่ยวกับการฝึกพิเศษ เพื่อให้มีความเหมาะสม สอดคล้องตามแผนงานป้องกันชายแดนของกองทัพภาคที่ 3 พ.ศ.2539 กองทัพน้อยที่ 3 ได้รับมอบภารกิจ อำนวยการในการฝึก ประลองยุทธ์ระดับกรมผสม ซึ่งเป็นการฝึกสองฝ่ายของหน่วยระดับกรมผสมเป็นครั้งแรก ของกองทัพไทย
พ.ศ. 2540-2544 กองทัพน้อยที่ 3 ได้เข้าร่วมการฝึกร่วมกองทัพไทย การาฝึกร่วมกองทัพอากาศ และการฝึกผสมไทย-สหรัฐ รหัส balance torch 001 พ.ศ. 2553 เข้าร่วมการฝึกร่วมผสมไทย-สหรัฐ ในรหัส การฝึกคอบร้าโกลด์ โดยมีแม่ทัพน้อยที่ 3 เป็นผู้บัญชาการกองกำลังเฉพาะกิจร่วม/ผสม จำนวน 8 ครั้ง
ในอดีตที่ผ่านมาจนถึงปัจจุบัน กองทัพน้อยที่ 3 ได้มีแม่ทัพน้อยที่ 3 ทั้งหมด 30 ท่าน พล.ท.กิตติพงษ์ แจ่มสุวรรณ ดำรงตำแหน่ง แม่ทัพน้อยที่ 3 ตั้งแต่วันที่ 1 เมษายน 2567 จนถึงปัจจุบัน