วันที่ 30 กันยายน 2559 นายวีระชัย สายต่างใจ หัวหน้ากลุ่มส่งเสริมและพัฒนาเกษตรกร สำนักงานเกษตรจังหวัดพิษณุโลก เปิดเผยว่า สถานการณ์น้ำท่วมส่งผลกระทบกับนาข้าวพื้นที่เกษตรใน จ.พิษณุโลก แบ่งเป็น 2 ครั้ง ครั้งแรกเกิดเมื่อช่วง 29 มิถุนายน ครั้งนั้นเกิดในพื้นที่ อ.นครไทย มีนาข้าวเสียหาย 12,000 ไร่ จากพื้นที่ทั้งหมด 15,294 ไร่ มีเกษตรกรได้รับผลกระทบ 1,752 ราย เป็นเงิน 17 ล้านบาท ชุดแรกได้พิจารณาช่วยเหลือไปแล้ว ส่วนครั้งที่ 2 เกิดขึ้นเมื่อวันที่ 13 กันยายน จนถึงปัจจุบัน ยังไม่สิ้นสุด เนื่องจากมีน้ำเหนือจาก จ.สุโขทัยไหลหลากมาพื้นที่ จ.พิษณุโลก อย่างรวดเร็ว ส่งผลให้นาข้าวถูกน้ำท่วมขังในพื้นที่ 8 อำเภอ ยกเว้นเพียง อ.วัดโบสถ์ มีเกษตรกรได้รับผลกระทบแล้ว 5,700 ราย มีพื้นที่เสียหาย 60,000 ไร่ คิดวงเงินความเสียหายคราวๆ ประมาณ 70 ล้านบาท โดยอำเภอที่ได้รับผลกระทบหนักคือ อ.พรหมพิราม และ อ.บางระกำ ขณะนี้ทางเจ้าหน้าที่เกษตรได้ลงพื้นที่เก็บข้อมูล ในระยะเวลา 90 วันนี้ ซึ่งการสำหรับครั้งนี้ไม่รวมถึงพื้นที่เกษตรเขตชลประทาน ยม-น่าน ที่มีกว่า 1,200,000 ไร่
นายวีระชัย กล่าวว่า จ.พิษณุโลกปีนี้นับว่าเกษตรกรได้รับความเดือดร้อนมาก ต่อเนื่องตั้งแต่ช่วงภัยแล้ง เกษตรกรในพื้นที่ มีผลผลิตขาดแคลนน้ำเสียหายจำนวนมาก ซึ่งทาง สนง.เกษตรจังหวัดได้ช่วยเหลือดูแลชดเชยความเสียหาย จำนวน 72 ล้านบาท เฉพาะในพื้นที่ อ.พรหมพิราม อำเภอเดียวเสียหายมาก ต้องจ่ายเงินชดเชยเกษตรกรเป็นวงเงิน 45 ล้านบาท และครั้งนี้ยังมาถูกน้ำท่วมซ้ำเติมอีก
สาเหตุของพื้นที่นาข้าวเสียหายมาก เพราะปกติ ชาวนาจะลงมือทำนาในช่วงเดือนเมษายน เก็บเกี่ยวเสร็จ เดือนกรกฎาคมพอดีก่อนน้ำมา แต่มีน้ำน้ำแล้ว เกษตรกรรอน้ำทำนา ทำให้ข้าวในนาช่วงนี้จึงเป็นข้าวที่กำลังตั้งท้อง และออกรวงใกล้เก็บเกี่ยว ก็เกี่ยวหนีน้ำไม่ทันจมอยู่ใต้หมด ซึ่งตัวเลขความเสียหายที่จะได้รับการช่วยเหลือครั้งนี้กว่า 70 ล้านบาท แบ่งเป็นการช่วยเหลือชดเชย นาข้าว ไร่ละ 1,113 บาท พืชไร่ ชดเชยให้ไร่ละ 1,148 บาท และพืชสวน ชดเชยไร่ละ 1,690 บาท
นายบรรดิษฐ์ อินต๊ะ ผู้อำนวยการโครงการชลประทานพิษณุโลก เปิดเผยว่า ขณะนี้น้ำจากแม่น้ำยมที่เออล่นตลิ่งตั้งแต่กลางเดือนกันยายน 2559 ท่วมพื้นที่ลุ่มต่ำในเขต อ. กงไกรลาศ จ.สุโขทัย . อ พรหมพิราม อ. เมือง และ อ.บางระกำ จ.พิษณุโลก มีน้ำเข้าท่วมในพื้นที่ลุ่มต่ำ ประมาณ 71,000 ไร่ คิดเป็นปริมาณน้ำที่จังหวัดพิษณุโลก-สุโขทัย หน่วงไว้ให้แก่พื้นที่ ลุ่มเจ้าพระยาตอนล่าง ประมาณ 120 ล้าน ลบ ม.นอกจากนี้ยังมีแก้มลิงในเขตอ.บางระกำ จ.พิษณุโลกอีก 3 บึง อีก จำนวน15 ล้าน ลบ.ม. รวมขณะนี้น้ำจากแม่น้ำยมที่ท่วมในพิษณุโลกและสุโขทัย มีน้ำอยู่ประมาณ 135 ล้าน ลบ ม. เป็นการหน่วงน้ำช่วยพื้นที่ลุ่มต่ำเจ้าพระยาตอนล่าง